MICAS: Microsatellite Analysis Server 3.0

All Non-Coding Repeats of Chlamydia psittaci VS225 plasmid pcpVS225

Total Repeats: 43

S.No.	Genome ID	Motif	Iterations	Length	Start	End	A%	T%	G%	C%	Protein ID
1	NC_018638	GT	3	6	56	61	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
2	NC_018638	ACA	2	6	67	72	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
3	NC_018638	ATT	2	6	73	78	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
4	NC_018638	GAAA	2	8	124	131	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
5	NC_018638	CA	3	6	215	220	50 %	0 %	0 %	50 %	Non-Coding
6	NC_018638	A	7	7	274	280	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
7	NC_018638	CTA	2	6	356	361	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
8	NC_018638	A	7	7	378	384	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
9	NC_018638	AAT	2	6	416	421	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
10	NC_018638	A	6	6	430	435	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
11	NC_018638	ATC	2	6	453	458	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
12	NC_018638	TA	3	6	465	470	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
13	NC_018638	T	7	7	1453	1459	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
14	NC_018638	ACC	2	6	1473	1478	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
15	NC_018638	ACC	2	6	1495	1500	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
16	NC_018638	ACC	2	6	1517	1522	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
17	NC_018638	ACC	2	6	1539	1544	33.33 %	0 %	0 %	66.67 %	Non-Coding
18	NC_018638	TTC	2	6	1556	1561	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
19	NC_018638	TGC	2	6	1613	1618	0 %	33.33 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
20	NC_018638	TC	3	6	3486	3491	0 %	50 %	0 %	50 %	Non-Coding
21	NC_018638	T	6	6	3510	3515	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
22	NC_018638	A	8	8	3529	3536	100 %	0 %	0 %	0 %	Non-Coding
23	NC_018638	AT	3	6	3549	3554	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
24	NC_018638	TTAA	2	8	3555	3562	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
25	NC_018638	TAATT	2	10	4400	4409	40 %	60 %	0 %	0 %	Non-Coding
26	NC_018638	T	8	8	4408	4415	0 %	100 %	0 %	0 %	Non-Coding
27	NC_018638	CAA	2	6	4422	4427	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
28	NC_018638	ATT	2	6	6895	6900	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
29	NC_018638	TG	4	8	6940	6947	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
30	NC_018638	AAC	2	6	7008	7013	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
31	NC_018638	TTTC	2	8	7029	7036	0 %	75 %	0 %	25 %	Non-Coding
32	NC_018638	TCT	2	6	7107	7112	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
33	NC_018638	AGAA	2	8	7160	7167	75 %	0 %	25 %	0 %	Non-Coding
34	NC_018638	AGT	2	6	7259	7264	33.33 %	33.33 %	33.33 %	0 %	Non-Coding
35	NC_018638	GT	3	6	7263	7268	0 %	50 %	50 %	0 %	Non-Coding
36	NC_018638	AGC	2	6	7295	7300	33.33 %	0 %	33.33 %	33.33 %	Non-Coding
37	NC_018638	TA	3	6	7305	7310	50 %	50 %	0 %	0 %	Non-Coding
38	NC_018638	CTAA	2	8	7314	7321	50 %	25 %	0 %	25 %	Non-Coding
39	NC_018638	AAT	2	6	7346	7351	66.67 %	33.33 %	0 %	0 %	Non-Coding
40	NC_018638	TCA	2	6	7370	7375	33.33 %	33.33 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
41	NC_018638	TAT	2	6	7447	7452	33.33 %	66.67 %	0 %	0 %	Non-Coding
42	NC_018638	TTC	2	6	7507	7512	0 %	66.67 %	0 %	33.33 %	Non-Coding
43	NC_018638	ACA	2	6	7548	7553	66.67 %	0 %	0 %	33.33 %	Non-Coding

©2012. Centre for DNA Fingerprinting & Diagnostics (CDFD), Hyderabad.